Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CBFBQ13951 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CBFBQ13951 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CBFBQ13951 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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CBFBQ13951 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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CBFBQ13951 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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CBFBQ13951 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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CBFBQ13951 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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CBFBQ13951 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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CBFBQ13951 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CBFBQ13951 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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