Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
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TUBA3CQ13748 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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TUBA3CQ13748 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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TUBA3CQ13748 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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TUBA3CQ13748 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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TUBA3CQ13748 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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