Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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