Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX1P78337 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX1P78337 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX1P78337 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX1P78337 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX1P78337 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX1P78337 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PITX1P78337 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PITX1P78337 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITX1P78337 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITX1P78337 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITX1P78337 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITX1P78337 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITX1P78337 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX1P78337 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234 ms