Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP46P62068 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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USP46P62068 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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USP46P62068 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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USP46P62068 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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USP46P62068 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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USP46P62068 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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USP46P62068 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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USP46P62068 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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USP46P62068 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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USP46P62068 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP46P62068 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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