Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRCC3P46736 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms