Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms