Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOEP02649 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOEP02649 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOEP02649 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOEP02649 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOEP02649 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOEP02649 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOEP02649 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOEP02649 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOEP02649 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOEP02649 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOEP02649 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOEP02649 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOEP02649 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOEP02649 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOEP02649 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOEP02649 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOEP02649 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOEP02649 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOEP02649 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOEP02649 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOEP02649 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
APOEP02649 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOEP02649 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms