Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX11Q9Y5W9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms