Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB12Q9Y5F1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB12Q9Y5F1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB12Q9Y5F1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB12Q9Y5F1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB12Q9Y5F1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms