Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y294

ASF1A, Histone chaperone ASF1A, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1AQ9Y294 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASF1AQ9Y294 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms