Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZMYND8Q9ULU4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZMYND8Q9ULU4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms