Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PACSIN3Q9UKS6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms