Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPN3Q9UHW5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms