Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EBF1Q9UH73 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF1Q9UH73 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms