Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEPT3Q9UH03 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEPT3Q9UH03 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms