Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC32.66■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
IFT172Q9UG01 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
IFT172Q9UG01 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms