Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLN8Q9UBY8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms