Protein–RNA interactions for Protein: Q9P278

FNIP2, Folliculin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNIP2Q9P278 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNIP2Q9P278 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms