Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV92

NDFIP2, NEDD4 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2Q9NV92 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NDFIP2Q9NV92 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDFIP2Q9NV92 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms