Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms