Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB90

RRAGC, Ras-related GTP-binding protein C, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGCQ9HB90 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRAGCQ9HB90 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRAGCQ9HB90 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RRAGCQ9HB90 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRAGCQ9HB90 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRAGCQ9HB90 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RRAGCQ9HB90 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRAGCQ9HB90 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RRAGCQ9HB90 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRAGCQ9HB90 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRAGCQ9HB90 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRAGCQ9HB90 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRAGCQ9HB90 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRAGCQ9HB90 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RRAGCQ9HB90 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRAGCQ9HB90 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRAGCQ9HB90 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRAGCQ9HB90 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms