Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VIPAS39Q9H9C1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIPAS39Q9H9C1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIPAS39Q9H9C1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms