Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C11orf49Q9H6J7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C11orf49Q9H6J7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C11orf49Q9H6J7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms