Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM12Q9H4Q4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms