Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC8Q9H0W5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC8Q9H0W5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms