Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CIPCQ9C0C6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms