Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPEF2Q9C093 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPEF2Q9C093 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms