Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP3Q9BZ76 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP3Q9BZ76 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP3Q9BZ76 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP3Q9BZ76 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP3Q9BZ76 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP3Q9BZ76 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP3Q9BZ76 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP3Q9BZ76 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP3Q9BZ76 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP3Q9BZ76 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP3Q9BZ76 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP3Q9BZ76 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP3Q9BZ76 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP3Q9BZ76 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP3Q9BZ76 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP3Q9BZ76 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP3Q9BZ76 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP3Q9BZ76 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP3Q9BZ76 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP3Q9BZ76 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP3Q9BZ76 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP3Q9BZ76 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTNAP3Q9BZ76 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNTNAP3Q9BZ76 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNTNAP3Q9BZ76 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP3Q9BZ76 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP3Q9BZ76 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP3Q9BZ76 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP3Q9BZ76 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP3Q9BZ76 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP3Q9BZ76 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms