Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG5

PARD6B, Partitioning defective 6 homolog beta, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6BQ9BYG5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PARD6BQ9BYG5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARD6BQ9BYG5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms