Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY5

CAPS2, Calcyphosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPS2Q9BXY5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPS2Q9BXY5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPS2Q9BXY5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPS2Q9BXY5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms