Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms