Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.45■■■□□ 2.95
LMTK3Q96Q04 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LMTK3Q96Q04 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms