Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms