Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM47Q96LD4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms