Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCORQ96JN0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCORQ96JN0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCORQ96JN0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCORQ96JN0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCORQ96JN0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCORQ96JN0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LCORQ96JN0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LCORQ96JN0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LCORQ96JN0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LCORQ96JN0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LCORQ96JN0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LCORQ96JN0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LCORQ96JN0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LCORQ96JN0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LCORQ96JN0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LCORQ96JN0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LCORQ96JN0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LCORQ96JN0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LCORQ96JN0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LCORQ96JN0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LCORQ96JN0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LCORQ96JN0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LCORQ96JN0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LCORQ96JN0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LCORQ96JN0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LCORQ96JN0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LCORQ96JN0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LCORQ96JN0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms