Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGF29Q96ES7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms