Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL29Q96CT2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms