Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC33.79■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.77■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC33.77■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TRIM52Q96A61 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM52Q96A61 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms