Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNPO1Q92973 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNPO1Q92973 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNPO1Q92973 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms