Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms