Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms