Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms