Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCX0

CCDC150, Coiled-coil domain-containing protein 150, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC150Q8NCX0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC150Q8NCX0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC150Q8NCX0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC150Q8NCX0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC150Q8NCX0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC150Q8NCX0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC150Q8NCX0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC150Q8NCX0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC150Q8NCX0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC150Q8NCX0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC150Q8NCX0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC150Q8NCX0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC150Q8NCX0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC150Q8NCX0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms