Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMNTD1Q8N9Z9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNTD1Q8N9Z9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD1Q8N9Z9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms