Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1I0

DOCK4, Dedicator of cytokinesis protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DOCK4Q8N1I0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DOCK4Q8N1I0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DOCK4Q8N1I0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
DOCK4Q8N1I0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DOCK4Q8N1I0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DOCK4Q8N1I0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DOCK4Q8N1I0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DOCK4Q8N1I0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DOCK4Q8N1I0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DOCK4Q8N1I0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DOCK4Q8N1I0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DOCK4Q8N1I0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DOCK4Q8N1I0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DOCK4Q8N1I0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DOCK4Q8N1I0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DOCK4Q8N1I0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms