Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJD3Q8N144 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms