Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RD3Q7Z3Z2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RD3Q7Z3Z2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms