Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3D4

LYSMD3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD3Q7Z3D4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYSMD3Q7Z3D4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYSMD3Q7Z3D4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYSMD3Q7Z3D4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYSMD3Q7Z3D4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYSMD3Q7Z3D4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYSMD3Q7Z3D4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYSMD3Q7Z3D4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYSMD3Q7Z3D4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYSMD3Q7Z3D4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYSMD3Q7Z3D4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYSMD3Q7Z3D4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYSMD3Q7Z3D4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYSMD3Q7Z3D4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LYSMD3Q7Z3D4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LYSMD3Q7Z3D4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LYSMD3Q7Z3D4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LYSMD3Q7Z3D4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LYSMD3Q7Z3D4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYSMD3Q7Z3D4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LYSMD3Q7Z3D4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms