Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDPD3Q7L5L3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDPD3Q7L5L3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms